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陵园规模宏大，格局严谨。孝陵建筑自下马坊至宝城，纵深2。62公里，陵寝主体建筑当年建有红墙围绕，周长2。25公里。现存遗址可分为两大部分。第一部分：蜿蜒曲折的陵墓神道。自下马坊至孝陵正门（文武方门）包括下马坊、神烈山碑、大金门、神功圣德碑及碑亭（俗称四方城）、神道石刻和御河桥。下马坊、神烈山碑：下马坊，是一座二间柱的石牌坊，面阔4。94米、高7。85米，坊额上刻“诸司官员下马”6个楷书字，告示进入明孝陵的官员必须下马步行，以示对开国皇帝朱元璋的尊敬。神烈山碑，在下马坊东边36米处，是明嘉靖十年（1531）立，正面y文双钩浅刻“神烈山”3字，原有碑亭，现已不存在，仅存四角石柱础。神烈山碑是明嘉靖十年改钟山为神烈山时而立。再向东17米处有一块卧碑，为“禁约碑”是明崇桢十四年（1641）立，碑文刻禁止损坏孝陵及谒陵的有关9条禁约。大金门、神功圣德碑及碑亭：大金门，在下马坊西北750余米处，是孝陵的第一道正南大门。大金门原为黄s琉璃瓦重檐式建筑，现存砖石砌筑的墙壁，下部为石造须弥座，面阔26。66米，进深8。09米，墙壁辟有3个券门d，中门较高为5。05米，左右两门高4。25米。神功圣德碑及碑亭，在大金门正北70米处，是明成祖朱棣于永乐十一年（1413）为朱元璋撰述的歌功颂德碑及碑亭。原碑亭为砖石砌筑，平面呈正方形，亭子的结构顶部已荡然无存，现仅存四壁，每壁各有一个宽5米的拱形门d，外观如一个城堡，故俗称“四方城”神道石刻：四方城向西北行约100米过御河便进入神道。明孝陵神道的最大特点在于建筑与地形地势的完美结合。其不同于历代帝陵神道成直线形，而是完全依地形山势建造为蜿蜒曲折的布局。而且在每一段落的节点处安放石像生来控制空间，形成一派肃穆气氛。石像生下铺垫有完整的六朝砖，使其600年来没有下沉。神道由东向西北延伸，两旁依次排列着狮子、獬豸、骆驼、象、麒麟、马6种石兽，每种2对，共12对24件，每种两跪两立，夹道迎侍。这段神道现俗称为石像路，全长615米。石兽的尽头，神道折向正北，至棂星门，长250米。这段神道置石望柱和石人，2根望柱呈六棱柱形，高6。6米，其上雕刻云龙纹。
通常望柱均置于神道的最前面，而明孝陵的望柱则置于神道中间，这也是朱元璋的独特之处。石望柱之后是东西相对而立的翁仲，有武将、文臣各2对，共8尊，高各为3。18米棂星门、御河桥：神道向北18米的尽头为棂星门，门已不存，仅存石柱础6个。从遗迹看，棂星门应是三开间的建筑。过棂星门折向东北275米，即到御河桥，也称金水桥。御河桥为石砌桥，原为5孔，现存3孔，桥基和河两边驳岸的石构件均是明代原物。通过御河桥向北，顺缓坡而上，便是陵寝的主体建筑。第二部分：明孝陵寝主体建筑。自正门至崇丘，包括文武方门（即正门）、碑殿、享殿、大石桥、方城、明楼、宝顶等，筑有围墙。陵寝建筑都是按中轴线配制，体现了我国传统建筑的风格。文武方门：文武方门是孝陵的正门，原为5个门d，3大2小，中间3个为拱形门d，两边2个为长方形门d。庑殿顶上盖黄s琉璃瓦。清朝同治年间改建为一个门d，上嵌清石门额，y刻楷书“明孝陵”3字。1999年重新进行修复，恢复了明代时大门的原貌。
现为五门，黄瓦、朱门、红墙，正门上方悬挂武方门”4个鎏金大字。正门东侧立有一块“特别告示”碑，此碑是清宣统元年（1909）所立，警示保护孝陵的注意事项。碑殿：碑殿原为孝陵享殿前的中门，即孝陵门，原为5个门d，后被毁。现在的碑殿是清朝时改建的，是一歇山顶，三开间，红墙小瓦建筑，南北正中各开一门，亭内立有5块碑刻。正中一块上刻“治隆唐宋”4个鎏金大字，这是清康熙皇帝1699年第三次下江南谒陵时御题。这是因清朝刚统治中国，康熙执政初，汉人不服满人统治，在这样的历史背景下，康熙深知，光靠高压政策是不行的，还须依靠汉人。所以，康熙在6次南巡中，5次拜谒明孝陵。此碑由曹雪芹的祖父、当时的“江宁织造”郎中曹寅刻立。在“治隆唐宋”碑左右还有清朝乾隆皇帝诗碑各一块，东西有卧碑两块，分别记叙康熙、乾隆谒陵纪事等。享殿：碑殿之后是孝陵的主要建筑孝陵殿，即享殿。原孝陵殿已毁，尚存3层须弥座台基，通高3。03米，台基上有大型柱础56个。台基四角有石雕螭首，大殿前后各有3道踏垛，尚存6块浮雕云龙山水大陛石。大殿基长57。30米、宽26。6米，可见当时该建筑之宏大。原殿中供奉朱元璋及马皇后神位。现存建筑是清朝同治年间两次重建的三小间享殿。现殿内是“明孝陵史料陈列室”殿后100余米处是大石桥又称升仙桥。过了大石桥就到了孝陵地面建筑的最后部分方城、明楼、宝顶。方城、明楼、宝顶：方城是孝陵宝顶前面的一座巨大建筑，外部用大条石建成，东西长75。26米，南北宽30。94米、前高16。25米、后高8。13米，底部为须弥座。方城正中为一拱门，中通圆拱形隧道。由54级台阶而上出隧道，迎面便是宝顶南墙，用13层条石砌筑。正中横刻“此山明太祖之墓”显然为后人所制。沿方城左右两侧步道即可登上明楼。明楼在方城之上